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研究業績

国際学会

1. “Disordered tail of the linker histone H1 in chromatin compaction dynamics studied by coarse-grained simulations”
   Nobu C. Shirai and Shoji Takada, Protein Society 30th Anniversary Symposium, Baltimore, Maryland, PE-027, Jul. 17, 2016.
   
   
2. “THE INTERPLAY OF INTRINSIC DISORDER AND MACROMOLECULAR CROWDING ON α-SYNUCLEIN FIBRIL FORMATION.”
   Nobu C. Shirai and Macoto Kikuchi, Biophysical Society 60th Annual Meeting, Los Angeles, California, 2723-Pos, Mar. 2, 2016.
   
   
3. “Statistical enumeration of self-avoiding polygons on a torus”
   Nobu C. Shirai, Quantum Information via Statistical Mechanics – Counting Steps toward Realization -, Kyoto, Jan. 2013
   
   
4. “Multicanonical simulation of the Domb-Joyce model and the Go model: new enumeration methods of self-avoiding walks”
   Nobu C. Shirai and Macoto Kikuchi, CCP2012, Kobe, Oct. 2012
   
   
5. “A lattice model of Intrinsically Disordered Proteins”
   Nobu Shirai, 2010 NCTS September Workshop on Critical Phenomena and Complex Systems, Academia Sinica, Taiwan, Sep. 2010
   
   

日本生物物理学会

1. “Relation between cooperative protein folding and loop connections: comprehensive analysis over 2α-4β protein topologies”
   Nobu C. Shirai and Minami Shintaro, 3Pos034, Kumamoto, Sep. 21 (2017).
   
   
2. “Relation between cooperative protein folding and loop connections”
   Nobu C. Shirai and Minami Shintaro, 3Pos053, Tsukuba, Nov. 27 (2016).
   
   
3. “Disordered tail of the linker histone H1 in chromatin compaction dynamics studied by coarse-grained simulations”
   Nobu C. Shirai and Shoji Takada, 1O1600, Kanazawa, Sep. 13 (2015).
   
   
4. “Intrinsic disorder under crowded environment: thermodynamic simulation of α-synuclein amyloid fibril formation”
   Nobu C. Shirai, 3SEA-06, Sapporo, Sep. 27 (2014).
   
   
5. “Coarse-grained simulation of chromatosome: H1-mediated dynamic compaction of nucleosome structure”
   Nobu C. Shirai and Shoji Takada, 3P118, Sapporo, Sep. 27 (2014).
   
   
6. “Macromolecular crowding effect on fibril formation of α-synuclein”
   Nobu C. Shirai and Macoto Kikuchi, 2P074, Kyoto, Oct. 29 (2013).
   
   
7. “The possible advantage of structural disorder of intrinsically disordered proteins in the new type of signaling mechanism”
   Nobu C. Shirai and Macoto Kikuchi, 1B1534, Nagoya, Sep. 22 (2012).
   
   
8. “Binding Process of Intrinsically Disordered Protein Studied by a Lattice Model of Protein”
   Nobu Shirai and Macoto Kikuchi, 1F1648, Kobe, Sep. 16 (2011).
   
   
9. “A Lattice Model of Intrinsically Disordered Proteins”
   Nobu Shirai and Macoto Kikuchi, 2P056, Sendai, Sep. 21 (2010).
   
   

日本物理学会

1. ファネルガスモデルによる蛋白質大規模系の熱力学的解析
   多田 吉克、菊池 誠、白井 伸宙、日本物理学会、金沢大、14pBE-10、2016年9月
   
   
2. α-シヌクレイン繊維形成に対する分子混雑の影響
   白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、東海大、27aAB-6、2014年3月
   
   
3. 天然変性タンパク質の構造ゆらぎを生かした密度変化誘起型シグナル伝達過程II
   白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、徳島大、28aPS-108、2013年9月
   
   
4. 拡張アンサンブル法を用いたself-avoiding walkの数の推定
   白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、広島大、26pXR-5、2013年3月
   
   
5. 天然変性タンパク質の構造ゆらぎを生かした密度変化誘起型シグナル伝達過程
   白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、横浜国立大、20pAB-7、2012年9月
   
   
6. 格子ガスモデルを用いたタンパク質結合プロセスの熱力学的解析II
   白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、関西学院大、27aPS-33、2012年3月
   
   
7. 格子モデルを用いたIntrinsically Disordered Proteinの熱力学的解析II
   白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、富山大、24aPS-25、2011年9月
   
   
8. 格子ガスモデルを用いたタンパク質結合プロセスの熱力学的解析
   白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、新潟大、28aGV-9、2011年3月
   
   
9. 格子モデルを用いたIntrinsically Disordered Proteinの熱力学的解析
   白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、大阪府大、23aTG-7、2010年9月
   
   
10. Intrinsically disordered proteinの格子モデル
    白井伸宙、菊池誠、日本物理学会、岡山大、21aEF-11、2010年3月
    
    

蛋白質科学会

1. リンカーヒストン Hl の結合に伴うヌクレオソーム構造の凝縮ダイナミクス: Hl の変性部位に注目して
   白井伸宙、高田彰二、蛋白質科学会、徳島、1P-055、2015年6月
   
   
2. 統計力学モデルで探る天然変性タンパク質の機能—混雑した環境下でのシグナル伝達に注目して
   白井伸宙、菊池誠、蛋白質科学会、鳥取、2WC-3、2013年6月
   
   
3. 天然変性タンパク質の構造ゆらぎを生かした密度変化誘起型シグナル伝達過程
   白井伸宙、菊池誠、蛋白質科学会、名古屋、1P-060、2012年6月 (*ポスター賞受賞*楯の写真)
   
   

研究会

1. ファネル気体モデルの構築とその計算法について
   白井伸宙、第4回蛋白質間相互作用研究会、御殿場、2016年1月
   
   
2. “Lattice gas model for α-synuclein fibril formation under crowded environment”
   Nobu C. Shirai, Rare Event Sampling and Related Topics III, 統計数理研究所, 2015年11月
   
   
3. “Disordered tail of the linker histone H1 in chromatin compaction dynamics studied by coarse-grained simulations”
   Nobu C. Shirai and Shoji Takada, 「柔らかな分子系」国際シンポジウム（第3回公開シンポジウム）, 科学未来館, 2015年9月
   
   
4. リンカーヒストンが引き起こすクロマチン構造のコンパクト化のダイナミクス
   白井伸宙、機能物性融合科学研究会シリーズ2「ソフトダイナミクス」、物性研、2015年4月
   
   
5. リンカーヒストンが引き起こすクロマチン構造のコンパクト化のダイナミクス
   白井伸宙、第3回天然変性タンパク質計算科学セミナー、御殿場、2015年3月
   
   
6. α-シヌクレイン繊維形成に対する分子混雑の影響
   白井伸宙、第2回天然変性タンパク質計算科学セミナー、御殿場、2014年2月
   
   
7. 統計力学モデルで探る天然変性タンパク質の機能―混雑した環境下でのシグナル伝達に注目して
   白井伸宙、京阪計算生物物理セミナー、京大、2013年3月
   
   
8. “New statistical enumeration methods for self-avoiding walks”
   Nobu C. Shirai and Macoto Kikuchi, 4th YSM-SPIP, 仙台, 2012年12月
   
   
9. 拡張アンサンブル法を用いたself-avoiding walkの数の推定
   白井伸宙、数理解析研究所、2012月10月
   
   
10. 格子ガスモデルを用いたタンパク質結合プロセスの熱力学的解析
    白井伸宙、菊池誠、研究会「情報統計力学の最前線」、京大基研、2012年3月
    
    
11. 天然変性タンパク質の格子モデルとシミュレーション（天然変性タンパク質のサーベイ含む）
    白井伸宙、菊池誠、研究会「マルコフ連鎖モンテカルロ法とその周辺」 、統計数理研究所、2011年3月
    
    

夏の学校

1. 格子タンパク質モデルで語るタンパク質の熱力学 (ポスター)
   白井伸宙、菊池誠、第51回生物物理若手の会夏の学校、京都、2011年8月
   
   
2. 格子タンパク質モデルの応用－自己回避酔歩を数える－ (ポスター)
   白井伸宙、第56回物性若手夏の学校　長野、2011年8月
   
   
3. モンテカルロ・カウンティング－自己回避酔歩を数える－ (分科会)
   白井伸宙、第56回物性若手夏の学校　長野、2011年8月
   
   
4. 天然変性タンパク質の格子モデル (ポスター)
   白井伸宙、第55回物性若手夏の学校、愛知、2010年8月